Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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