Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN4Q8IWV2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms