Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms