Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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