Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms