Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms