Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms