Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM69BQ5VUD6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms