Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIF1Q5UIP0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms