Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCID2Q5JVF3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms