Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms