Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms