Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms