Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P3H1Q32P28 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P3H1Q32P28 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms