Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms