Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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