Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms