Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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