Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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