Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC1A5Q15758 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms