Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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