Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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