Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNGB1Q14028 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB1Q14028 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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