Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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