Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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