Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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