Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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