Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms