Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms