Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms