Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABPAQ06546 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPAQ06546 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms