Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms