Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms