Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms