Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAP1Q01518 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAP1Q01518 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms