Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms