Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms