Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms