Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms