Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms