Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2FP61218 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2FP61218 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms