Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms