Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNTBP49356 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FNTBP49356 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FNTBP49356 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms