Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms