Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NESP48681 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NESP48681 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NESP48681 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NESP48681 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NESP48681 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NESP48681 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NESP48681 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms