Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMD8P48556 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms