Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCG1P45844 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms