Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSFMP43897 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TSFMP43897 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSFMP43897 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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