Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK1P39086 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK1P39086 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms