Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms